Axiom ジャポニカアレイ NEO
カートリッジアレイ
アレイプレート
画像1: https://www.atpress.ne.jp/releases/193325/LL_img_193325_1.jpg
Axiom ジャポニカアレイ NEO
Axiom ジャポニカアレイ NEO
https://www.thermofisher.com/jp/ja/home/life-science/microarray-analysis/human-genotyping-pharmacogenomic-microbiome-solutions-microarrays/axiom-japonica-arrays-neo.html
Axiom ジャポニカアレイ NEOは、 東北大学東北メディカル・メガバンク機構が構築した日本人3,552人の全ゲノムシーケンスデータベースを元に設計された、日本人の全ゲノム解析に非常に適したジェノタイピング(※1)用のDNAマイクロアレイ(※2)です。
この度米国サーモフィッシャーサイエンティフィックインコーポレイテッドは、国立大学法人東北大学とAxiom ジャポニカアレイ NEOの製造販売におけるライセンス契約を締結しました。これを受け、サーモフィッシャーサイエンティフィックインコーポレイテッドの日本法人であるサーモフィッシャーサイエンティフィック ジャパングループが日本国内における販売を行います。
Axiom ジャポニカアレイ NEOの特徴は、疾患関連因子として研究報告がある一塩基多型(SNP、スニップ)(※3)のなかでも、日本人特有の疾患に関連したSNPを選択して搭載している点です。Axiom ジャポニカアレイ NEOを用いて得られたデータは、Applied Biosystems Axiom Analysis Softwareを使用して解析します。加えて、東北大学東北メディカル・メガバンク機構が提供する遺伝子型インピュテーション(※4)により、数千万規模のSNP情報の取得が可能になります。このため、日本人特有の体質・疾患に関連する遺伝子の探索研究を強力に支援し、各個人に適した治療や予防方法の開発に貢献します。
また、Axiom ジャポニカアレイ NEOの高精度な解析を、サーモフィッシャーサイエンティフィックのApplied Biosystems Axiom Genotyping Solutionがプラットフォームとして支えています。Applied Biosystems Axiom Genotyping Solutionは、UKバイオバンク(イギリス)、Taiwan Precision Medicine and Taiwan Biobank(台湾)、FinnGen プレシジョンメディシン スタディ(フィンランド)など、世界各国のバイオバンクプロジェクトに採用された実績があり、高い信頼性を有しています。多種多様な人種のゲノム解析のために、研究目的や、研究対象となる人種に合わせて、柔軟なカスタムデザインが可能です。
サーモフィッシャーサイエンティフィック ジャパングループ代表の室田博夫は次のように述べています。
「この度の東北大学東北メディカル・メガバンク機構とのパートナーシップにより、日本人特有のゲノム解析を行うお客様にAxiom ジャポニカアレイ NEOをお届けできることを大変光栄に思います。『私たちの住む世界をより健康で、より清潔、より安全な場所にするために、お客様に製品・サービスを提供する』という当社のミッションを実現するために、今後も東北大学東北メディカル・メガバンク機構と協調し、個別化医療のさらなる進展に向けて取り組んでまいります」
■サーモフィッシャーサイエンティフィックのDNAマイクロアレイテクノロジー
サーモフィッシャーサイエンティフィックのDNAマイクロアレイは、半導体の製造に使われているフォトリソグラフィー技術とコンビナトリアル・ケミストリーを融合させた方法で製造されています。この技術により超高密度に集積されたオリゴヌクレオチドプローブアレイの製造が可能となり、少量のサンプルから高品質で網羅的なゲノムデータを得ることができます。
アレイは5インチ角のウェハーを用いて製造されます。プローブの合成完了後にウェハーを切断して得られた一つ一つのアレイが、カートリッジアレイ、アレイプレートといったさまざまなフォーマットに組み込まれます。
高度にコントロールされた製造プロセスにより、ロット間におけるマーカーの欠落なく、常に高い精度と再現性が確保されています。
画像2: https://www.atpress.ne.jp/releases/193325/img_193325_2.jpg
カートリッジアレイ
画像3: https://www.atpress.ne.jp/releases/193325/img_193325_3.jpg
アレイプレート
■用語・技術説明
※1. ジェノタイピング
遺伝子型決定・遺伝子型判定を指す。ある個体のDNA配列をDNAシークエンシングやマイクロアレイなどによって識別し、他の個体のDNA配列や基準となるDNA配列と比較することによって、遺伝子型の違いを検出する方法。
※2. DNAマイクロアレイ
ごく小さな微小物質である核酸(DNA)、ペプチド、抗体等をプラスチックやガラス等の基板上に高密度に配置した遺伝子解析用ツール。DNAマイクロアレイには、遺伝子発現やゲノム解析(ジェノタイピング解析、コピー数解析)の分野で広く用いられ、数千から数万種類のプローブを結合させることで、それらに対応した数の遺伝子を同時に検出することが可能。
※3. 一塩基多型(Single Nucleotide Polymorphism: SNP、スニップ)
ゲノム配列において、ある領域でDNAの塩基配列が個人間で一塩基のみ異なる多型のなかで一定以上のアレル(同じ座位上で対立して存在する塩基)頻度で存在するもの。
※4. 遺伝子型インピュテーション
SNPアレイの解析結果とハプロタイプリファレンスパネルとを組み合わせることでSNPアレイによる判定をしていない数百万のSNV(一塩基多様体)の遺伝子型を推定する統計学的手法。
『ジャポニカアレイ(R)』は国立大学法人東北大学の登録商標です。
■サーモフィッシャーサイエンティフィックインコーポレイテッドについて
サーモフィッシャーサイエンティフィックインコーポレイテッド(本社：米国マサチューセッツ州ウォルサム、NYSE:TMO)は、240億ドル超の収益と世界中に約70,000人の従業員を擁する、世界をリードする科学サービス企業です。私たちのミッションは、私たちの住む世界を「より健康で、より清潔、より安全な場所」にするために、お客様に製品・サービスを提供することです。私たちはお客様がライフサイエンス研究をさらに加速させ、分析における複雑な課題を解決し、臨床診断性能を向上させ、医薬品を市場に提供し、研究室の生産性を高めることを支援します。
当社の強力なブランドである、Thermo Scientific、Applied Biosystems、Invitrogen、Fisher Scientific、Unity Lab Servicesブランドは、革新的な技術、購入における利便性、包括的なサービスとサポートにおいて、他に類を見ない組み合わせを提供します。
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